上海基因组高通量测序

生工高通量测序样品要求，环境样品：如果是新鲜土壤/污泥样品，可以以冰袋运输，不超过3天;如果是冻存过的样品（-20°C或者-80°C冰箱保存），为避免反复冻融，建议用足量的干冰（根据经验，在秋冬季节，如果打包合适，3公斤块状干冰可以维持30-40小时）寄送;如果是水体样品，建议采用滤膜过滤后，将滤膜寄送来生工。生工不负责过滤。要求滤膜3张，冰袋运输，不超过3天。其余特殊环境样品，具体咨询生工高通量测序部。

DNA样品：请提供电泳胶图，浓度>20 ng/μl，总量一般1～2 μg。乙醇沉淀DNA或冻干DNA，可冰袋运输，不超过3天。 小RNA测测序不可采用常规柱式总RNA提取试剂盒。上海基因组高通量测序

生工高通量测序部拥有丰富的样品处理经验，日均处理样品200余例，涵盖污泥、粪便、海底沉泥、水体滤膜、植物组织、动物组织/细胞等样品，省去您处理样品的繁琐过程。生物信息分析经验丰富，可以满足客户标准分析到定制分析作图的需求。且生工一直秉持只要生工已经标准化的分析内容（以生工分析报告模板为准），全部free。生工生物拥有生命科学领域较全的产品及服务体系，可以承接从分子到蛋白各个层级的实验项目，一站式解决问题。同时生工生物单细胞团队目前已同时拥有10xGenomicsChromiumController和ChromiumX双平台，可为您提供超高通量和低通量单细胞样本双重。上海靶向捕获高通量测序应用单细胞转录组测序指在单细胞水平上对 mRNA 进行高通量测序和分析的技术。

单细胞测序技术的应用：单细胞测序技术可以检测复杂组织中单个细胞不同的生物学特性，这可以极大的帮助我们进一步了解细胞与细胞之间的差异。"这几乎就像通过几颗星星看到了整个宇宙。"哈佛大学分子和细胞生物学教授 Alexander Schier的这句话应用在这里也是很合适了。这幅图正是来自于在2018年4月 Science 杂志发表的三篇[8-10]来自哈佛医学院和哈佛大学的研究人员关于单细胞基因测序文章中的一幅结果图，Alexander Schier教授也是其中一篇文章的作者。这几篇文章使用多种检测技术组合，其中包括对数千个发育中的斑马鱼和青蛙胚胎单细胞测序，在胚胎发育建议初的24小时内追踪单个细胞的发育情况，可以揭示出胚胎细胞何时何地转变为新的细胞状态和类型并向我们展示了组织和整个机体从单细胞发育的完整历程。

核酸适配体测序，项目介绍：核酸适配体是一类能够特异性地和靶物质结合的寡核苷酸序列。它可作用于蛋白质、金属离子、小分子化合物、细胞膜表面受体等靶标。其结合能力可与抗体相当甚至更强，同时具有低免疫原性、 稳定性好等特点，并可结合各种药物及载体构建多元复合靶向给药系统用于tumour靶向treat, 在生物医学领域有潜在高价值。生工生物针对核酸适配体特殊结构，结合Illumina MiSeq测序平台，可以快速对核酸适配体文库进行大规模高通量测序，省去克隆测序的麻烦，提高测序深度，快速计算适配体序列频率，方便科研客户快速评估序列富集程度。生工高通量测序部拥有丰富的样品处理经验，日均处理样品200余例。

生工高通量测序样品要求，RNA样品：请提供浓度≥750 ng/μl、总量≥2μg的总RNA样品，样品请去蛋白并进行DNase处理;请务必提供每个样品具体的浓度、体积、制备时间以及物种来源。比较好附上QC数据，可以是电泳胶图、分光光度值、Nanodrop仪器检测数据或者Agilent Bioanalyzer仪器检测数据等;一般情况下，转录组测序需要Agilent Bioanalyzer仪器检测获得的总RNA 28S:18S≥1，RIN≥7;小RNA测测序不可采用常规柱式总RNA提取试剂盒，可选择传统总RNA提取法（如乙醇沉淀、异丙醇沉淀等）或者选用专门的小RNA提取试剂盒;寄送RNA样品请置于1.5 ml离心管中，管上注明样品名称、浓度以及制备时间，管口使用Parafilm封口。在运输前将所有样品管固定于50 ml带盖离心管中，再将50 ml管放在封口袋中。使用足量的干冰运输，并且尽量选用较快的邮递方式，以降低运输过程中样品降解的可能性。为什么要用单细胞测序技术？上海地区微生物高通量测序技术

单细胞测序技术可以检测复杂组织中单个细胞不同的生物学特性.上海基因组高通量测序

扩增子测序，项目介绍：随着基因编辑技术（尤其是CRISPR-cas9技术）的发展，科研人员使用传统的Sanger测序技术无法快速有效鉴定基因编辑效率。但是，通过对靶基因区域附近设计引物，进行PCR扩增，并对PCR产物进行高通量测序，可以快速高效的获得目标区域的突变频率信息，尤其是对低频突变的检测效果远远优于一代测序，性价比极高。16S全长分类测序，项目介绍：16S全长测序分析主要是对 16S rRNA基因全长进行扩增，基于PacBio 测序平台测序. 相比较二代测序只选择 1-2 个高变区进行测序，三代可以获得全长的 16S 序列，更多变异区信息可以提高物种鉴定的分辨率，还可以提高对于群落组成的鉴定的精度。另外，针对fungus/真核生物，也可以采用类似的办法，扩增ITS/18S全长，进行物种分类测序，提高鉴定精度。上海基因组高通量测序

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